GENÓMICA

Su actividad se centra en el diagnóstico de las enfermedades asociadas a alteraciones genéticas del ámbito del metabolismo y las cardiopatías. Desarrollansu trabajo en el laboratorio principal de la Fundación, actualmente en colaboración con los servicios de Endocrinología, Cirugía General y Cardiología del Hospital General de Valencia, así como con otras instituciones como el Centro de Investigación Príncipe Felipe de Valencia.

Prestan un asesoramiento especializado, tanto en el ámbito del conocimiento teórico como técnico. Su principal objetivo es la incorporación inmediata de cada hallazgo, cuyo impacto y aceptación internacional se acompañe de una mejora de la actividad asistencial rutinaria.

Además, en su laboratorio ofrecen formación especializada a estudiantes de grado y posgrado, interesados en sus líneas de estudio, que acuden a su laboratorio tanto para realizar sus prácticas externas como para llevar a cabo sus trabajos de fin de grado (TFGs).

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Goitzane Marcaida Benito

Licenciada en Medicina por la Universidad del País Vasco. En 1993 termina  la formación MIR en Análisis Clínicos en el Hospital General de Valencia y trabaja con distintas becas en el Instituto de Investigaciones Citológicas bajo la dirección de Vicente Felipo donde desarrolla su tarea investigadora en el campo de la neurociencia.

Grado de Doctor por la Universidad de Valencia, defendiendo la Tesis Doctoral "Mecanismo molecular de la toxicidad del amonio. Papel del receptor NMDA" en 1997 que mereció premio extraordinariode doctorado. Es en la actualidad Jefa del Servicio de Análisis Clínicos.

David dos Santos Albuquerque
Tel: 963131800 Ext.437317
correo electrónico: dossantos_davalb@gva.es

  1. Identificación de las bases genéticas de susceptibilidad a la obesidad severa y temprana, concretamente en las tres líneas de trabajo que desarrollamos desde nuestro Observatorio Valenciano para estudio de la obesidad (OVESO):
  • Estudio de perfiles poligénicos comunes de riesgo a desarrollar sobrepeso severo, entre los casos de obesidad común sin etiopatogenia conocida.
  • Estudios de los genes MC4R y LEPR en individuos pertenecientes a familias de alto riesgo afectadas de obesidad mórbida
  • Estudios de obesidad infantil asociada a fenotipos sindrómicos complejos con discapacidad intelectual.
  1. Diagnóstico genético y descripción fenotípica de las cardiopatías hereditarias o familiares (CF), estudiando  la eficiencia de la ecocardiografía y cardiorresonancia magnética 1.5 y 3 Tesla para la descripción anatómica, histológica y funcional de las estructuras cardiacas en portadores de mutación; el objetivo es la predicción del pronóstico de la patología y la toma de decisiones intervencionistas en base a las variables analizadas.

El grupo de Genómica, de la Fundación Investigación Hospital General Universitario de Valencia (FIHGUV) ofrece a la comunidad científica y empresarial, la tecnología e infraestructura necesarias en el área de la biología molecular, para el estudio de la información genética que posee un organismo.

Los servicios de análisis disponibles en el área de la biología molecular son obtención, cuantificación y electroforesis de ácidos nucleicos (ADN), PCR (del ingles polymerase chain reaction), purificación de material de PCR, secuenciación de ADN, análisis de fragmentos, análisis de SNPs (variantes genéticas), lo que permite llevar a cabo estudios de asociación genética y análisis de mutaciones.

Cartera de servicios ofertados por el grupo de Genómica FIHGUV

       
   

Tarifa FIHGUV

Tarifa pública

Tarifa privada

 

Extracción de ADN

Extracción de ADN (kit QIAmp de QIAGEN)

      3,50  €

          5,50  €

          8,50  €

 

Extracción + cuantificación + normalization

      4,50  €

          6,50  €

          9,50  €

 

Cuantificación

Espectrofotometría (Nanodrop)

      0,50  €

          0,75  €

          1,00  €

 

Amplificaciones

Diseño de oligonucleótidos

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PCR (condiciones facilitadas por solicitante)

      1,50  €

          2,00  €

          2,50  €

 

Electroforesis en geles de agarosa

      0,50  €

          0,65  €

          0,70  €

 

Electroforesis por capilar (por cada 12 muestras)

      6,00  €

          7,00  €

          9,00  €

 

PCR + purificación + cuantificación

      3,50  €

          4,00  €

          4,50  €

 

Secuenciación SANGER

Secuenciación de ADN solo migrar

      1,50  €

          2,00  €

          3,00  €

 

Secuenciación de ADN (placa 96 completa) solo migrar

  115,00  €

      150,00  €

      240,00  €

 

Purificación de PCR con ExoSap-it

      0,80  €

          1,10  €

          1,50  €

 

Purificación  de reacción + BigDye + migración

      3,50  €

          5,00  €

          6,50  €

 

Electroforesis capilar de fragmentos de ADN solo migrar

      2,50  €

          3,00  €

          3,50  €

 

Genotipado

TaqMan RT-PCR

 

 

 

 

Biomark HD FLUIDIGM (sondas TaqMan o SNPtype + nanofluídica)

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Secuenciación masiva

Secuenciación masiva utilizando la plataforma Illumina (miSeq)

(En breve)

 
 

Otros

Análisis bioinformático/bioestadístico de datos

 

 

 

 

Precio por hora

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Precios por muestra (IVA no incluido)

       

Investigadores (Ph.D)

Goitzane Marcaida Benito

David dos Santos Albuquerque

Raquel Rodríguez López

Marcos Bruna Esteban

Carlos Sánchez Juan

Óscar Fábregat Andrés

Lorenzo Fácila Rubio

 

Estudiantes

Fàtima Gimeno Ferrer

Carol Monzó Cataluña

Noelia Escartín Alarcón

1. Diferencias en la expresión de receptores opioides, cannabinoides e interleuquinas en linfocitos de pacientes con diagnóstico de síndrome de dolor de raquis postquirúrgico refractario, tratados con un sistema de estimulación medular. ¿Marcadores de evolución de la enfermedad?

Entidad financiadora: Ayudas concedidas a la investigación médica 2014 Fundación Mutua Madrileña Automovilista. XI Convocatoria de ayudas a la Investigación :
Investigador principal: Jorge Manzanares Robles (Alicante)
Centro: Universidad Miguel Hernández (Alicante) y Hospital General de Valencia.

2. Perspectivas de la cardiorresonancia magnética para el análisis anatómico e histológico de la miocardiopatía hipertrófica hereditaria.

Entidad financiadora: Convocatoria 2015 de ayudas para proyectos de investigación de la Fundación ERESA.
Investigador principal: Óscar Fabregat Andrés
Centro: Servicio de Cardiología y Servicio de Análisis Clínicos del HGV.

Capítulos de libros

  • Albuquerque D, Manco L, Nóbrega C. 2016. An overview of the Genetics of Human Obesity.  In: Obesity: A practical guide, (eds). Ahmad S; Imam S. pp.87-106. ISBN: 978-3-319-19821-7. Switzerland: Springer.
  • Rodríguez-López, R. 2015Heterogeneous Obesity Syndromes: New Strategies for Diagnosis. In: Molecular Mechanisms Underpinning the Development of Obesity, (eds). Nóbrega C, Rodríguez-López R, pp.23-35. ISBN: 978-3-319-12765-1. Switzerland: Springer.
  • Albuquerque D, Nóbrega C. 2015. Genetic Contribution: Common Forms of Obesity.  In: Molecular Mechanisms Underpinning the Development of Obesity, (eds). Nóbrega C, Rodríguez-López R, pp.37-55. ISBN: 978-3-319-12765-1. Switzerland: Springer.
  • Albuquerque D, Manco L, Nóbrega C. 2015. Epigenetics of human obesity: a link between genetics and nutrition.  In: Molecular Mechanisms Underpinning the Development of Obesity, (eds). Nóbrega C, Rodríguez-López R, pp.101-27.ISBN: 978-3-319-12765-1. Switzerland: Springer.
  • Albuquerque, David; Manco, Licínio; Nóbrega, Clévio. 2017. Molecular Biology of Human Obesity: Non-epigenetics in Comparison with Epigenetic Processes.  In Handbook of Nutrition, Diet, and Epigenetics, ed. Vinood PatelVictor Preedy, 1 - 18. ISBN: 978-3-319-31143-2. Cham: Springer International Publishing.
    doi: 10.1007/978-3-319-31143-2_7-1

Artículos

  1. Albuquerque D, Manco L, González LM, Gervasini G, Marcaida Benito G, González JR, Rodríguez-López R. Polymorphisms in the SRNPN gene are associated with obesity susceptibility among Spanish population.  2017 Apr 7. doi: 10.1002/jgm.2956.
  2. Albuquerque D, Stice E, Rodríguez-López R, Manco L, Nóbrega C. 2015. Current review of genetics of obesity: from molecular mechanisms to an evolutionary perspective. Mol GenetGenomics 290(4): 1191-221.
  3. Gamero-Villarroel C, Rodríguez-López R, Jimenez M, Carillo J, Garcia-Herraiz A, Albuquerque D, Flores I, Gervasini G. 2015. Melanocortin-4 receptor gene variants are not associated with binge-eating behaviour in non-obese patients with eating disorders. PsychiatricGenetics 25(1): 35-8.
  4. Rodríguez-López R, Albuquerque D, Santamaria M. 2014. Heredabilidad de la Obesidad. Caso Clínico: Obesidad no asociada a discapacidad intelectual. Ed ContLabClín 21: 14-23.
  5. Albuquerque D, Nóbrega C, Rodríguez-López R, Manco L. 2014. Association study of common polymorphisms in MSRA, TFAP2B, MC4R, NRXN3, PPARGC1A, TMEM18, SEC16B, HOXB5, and OLFM4 genes with obesity-related traits among Portuguese children. J Hum Genet 59(6): 307-313.
  6. Gamero-Villarroel C, Gordillo I, Carrillo JA, García-Herráiz A, Flores I, Jiménez M, Monge M, Rodríguez-López R, Gervasini G. BDNF genetic variability modulates psychopathological symptoms in patients with eating disorders. Eur Child Adolesc Psychiatry. 2014 Aug;23(8):669-79
  7. Albuquerque D, Estévez MN, VíboraPB, Giralt PS, Balsera AM, Cortés PG, López MJ, Luego LM, Gervasini G, Hernández SB, Arroyo-Díez J, Vacas MA, Nóbrega C, Manco L, Rodríguez-López R. 2014. Novel Variants in the MC4R and LEPR Genes among Severely Obese Children from the Iberian Population. Ann Hum Genet 78(3): 195-207.
  8. Albuquerque D, Nóbrega C, Manco L. 2013. Association of FTO polymorphisms with obesity and obesity-related outcomes in Portuguese children.PLoS One 8(1): e54370.
  9. Albuquerque D, Nóbrega C, Manco L. 2013. The lactase persistence -13910C>T polymorphism shows indication of association with abdominal obesity among Portuguese children. ActaPaediatr 102(4): e153-157.
  10. Rodríguez-López R, Pérez JM, Balsera AM, Rodríguez GG, Moreno TH, García de Cáceres M, Serrano MG, Freijo FC, Ruiz JR, Angueira FB, Pérez PM, Estévez MN, Gómez EG. The modifier effect of the BDNF gene in the phenotype of the WAGRO syndrome.Gene. 2013 Mar 10;516(2):285-90.
  11. Albuquerque D, Nóbrega C, Samouda H, Manco L. 2012. Assessment of obesity and abdominal obesity among Portuguese children.Acta Med Port 25(3): 169-173.
  12. González JR, González-Carpio M, Hernández-Sáez R, Serrano Vargas V, Torres Hidalgo G, Rubio-Rodrigo M, García-Nogales A, NúñezEstévez M, Luengo Pérez LM, Rodríguez-López R. FTO risk haplotype among early onset and severe obesity cases in a population of western Spain.Obesity (Silver Spring). 2012 Apr;20(4):909-15.
  13. Rodríguez-López R, González-Carpio M, Serrano MV, Torres G, García de Cáceres MT, Herrera T, Román A, Rubio M, Méndez P, Hernández-Sáez R, Núñez M, Luengo LM. Association of FTO gene polymorphisms and morbid obesity in the population of Extremadura (Spain).EndocrinolNutr. 2010 May;57(5):203-9.
  14. Albuquerque, David; Nóbrega, Clévio; Manco, Licínio; Padez, Cristina. 2017. "The contribution of genetics and environment to obesity", British Medical Bulletin 123, 1: 159 - 173. doi: 10.1093/bmb/ldx022
  15. Gamero-Villarroel, Carmen; González, Luz M; Rodríguez-López, Raquel; Albuquerque, David; Carrillo, Juan A; García-Herráiz, Angustias; Flores, Isalud; Gervasini, Guillermo. 2017. " Influence of TFAP2B and KCTD15 genetic variability on personality dimensions in anorexia and bulimia nervosa ", Brain and Behavior, na: e00784 - e00784. doi: 10.1002/brb3.784